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化合物ライブラリーの提供とは?課題と対策・製品を解説

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医薬・創薬
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医薬・創薬における化合物ライブラリーの提供とは?
医薬・創薬における化合物ライブラリーの提供は、新薬候補となる多様な化合物を集めたコレクションを研究機関や製薬企業に提供するサービスです。これにより、創薬初期段階におけるターゲット分子への結合性や薬効のスクリーニングを効率化し、開発期間の短縮とコスト削減に貢献します。
各社の製品
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ドラッグデザインソフト『MolDesk Screening』
MolDesk Screeningは、創薬支援用分子シミュレーションシステムmyPrestoを効率的に利用するためのGUIプログラムで、株式会社情報数理バイオが開発した製品です。myPrestoは、経済産業省、NEDO及びAMEDからの委託プロジェクトの中で開発されました。MolDesk Screening ver.1.1では、200万化合物を、PC (8並列)で半日から2日でバーチャルスクリーニングできます。バーチャルスクリーニングでは、ドッキングスコア順、MTS法、機械学習MTS法、機械学習DSI法の4つの異なるランキング手法を、状況に応じて使い分けることができます。
【特長】
■スレッド並列で高速にスクリーニング計算を実行
■上位化合物のドッキングポーズ確認が容易
■myPrestoのMolsiteによる高精度なポケット探索が可能
■タンパク質のアミノ酸を他のアミノ酸へ置換可能(化学修飾したアミノ酸を含む40種類に対応)
■MPI/GPU(NVIDIA CUDA)による高速なMD並列計算
詳しくはカタログをご覧頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
IT技術『ライフサイエンス分野における実験研究サポート』
株式会社バイオモデリングリサーチは、ライフサイエンス分野における実験研究をIT技術を用いて支援します。
薬剤候補化合物探索のための実験を速やかに開始できるように、ドッキング計算から実験開始までをサポートします。
バイオモデリングリサーチは、公益財団法人 計算科学振興財団が運用しているFOCUSスパコン、および東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターのHGCスパコン を利用しており、500コア以上を用いた大規模計算を比較的安価に実施することが可能です。
【特徴】
○インシスコ・スクリーニング計算では主にmyPrestoを使用
○株式会社フィアラックスが開発したMF myPresto販売・活用支援
○株式会社情報数理バイオが開発したMolDesk販売・活用支援
○バイオモデリングリサーチは、計算科学振興財団賛助会員
詳しくはお問い合わせ、または「PDFダウンロード」からご覧ください。
高精度物性予想『Calculator Plugins』
『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。
実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。
当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれており、計算したい項 目に応じて必要なバンドルを選んでご契約いただけます。
【特長】
■高いパフォーマンスと多様な活用法を実現
■薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価
■強力なリード生成・リード最適化ツール
■“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれている
■計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでできる
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
リニアグラジエント フラッシュクロマト装置



